Gestion des Base de données

2 Points différents à aborder :

• Une erreur dû au fait que quand une première fois on utilise un outils avec des "data" à download il n'y a pas de problème mais lorsqu'on utilise une fois prochaine un autre outil avec "data" alors un bug se créer sur la création du lien symbolique pour la base de données.

Il faut rendre cette étape plus générale en faisant le lien symbolique sur data/ ou on aurait un sous répertoire par type de database (FROGS_taxonomy, sortmerna...)

• Dans le cas d'un déploiement d'un workflow sur cluster de calcul comment aborder les bases de données ? Car elles ne peuvent pas être écrite à la racine dans /data/FROGS_taxonomy. Du coup où doivent être écrite les BDD dans le cas d'un lancement de pipeline sur HPC ? (paramètre lors de l'installation/deploiement sur hpc? répertoire de travail ? dans le répertoire Results ?)
• Il faudrait rendre l'écriture des base de données permanent en ayant un répertoire un peu comme le condabin ou les fichier serait écrit de manière permanente.